¿Ha habido alguna investigación sobre si existen bacterias u hongos capaces de influir en el comportamiento de sus huéspedes como lo hacen algunos parásitos?

Sí, Internet famoso “seta zombi”
Ophiocordyceps unilateralis – Wikipedia

Cuando una de sus esporas entra en contacto con una hormiga, entra en su cabeza y crece, tomando lentamente el control del comportamiento y los movimientos de la hormiga.

Cuando el hongo está listo, hace que la hormiga vaya a las superficies altas, por lo que el cuerpo puede morir mientras los hongos pueden separar sus esporas de un lugar eficiente.

En cuanto a las bacterias, hay otra que enloqueció por Internet, es la “bacteria amorosa del gato”:
Toxoplasma gondii – Wikipedia

Es una bacteria que solo puede reproducirse dentro del cuerpo de un gato. Su técnica para llegar allí es infectar a los ratones, cambiar su comportamiento para que ya no les teman a los gatos (incluso se sienten atraídos por la orina del gato), y se reproducen en el cuerpo del depredador una vez que el ratón ha sido comido.

La razón por la que se hizo famosa es porque también contaminó a más de la mitad de la población en muchos países, y porque … ¡también puede hacer que los humanos aman a los gatos!

Se ha demostrado que, hasta cierto punto, los humanos infectados con toxoplasmosis expresan más afecto hacia los gatos, lo que puede explicar su popularidad en todo el mundo, y por supuesto en Internet.

(Para los biólogos: sé que no es exactamente una bacteria, pero es un parásito microscópico, estoy seguro de que se ajusta a las expectativas de OP)

Así que sí, existen, ahora solo tenemos que esperar a científicos locos que quieran probar el efecto de algunos de ellos en humanos para tener nuestro propio apocalipsis zombi de la vida real.