Una ventaja plausible es que las proteínas de los virus -ssRNA se sintetizan de forma independiente, lo que confiere más libertad de evolución.
Por ejemplo, los rabdovirus tienen 5 genes, que dan lugar a 5 proteínas virales. Durante la replicación viral, cada gen se transcribe independientemente en un ARNm, como se muestra a continuación:
De modo que puede ver que los rabdovirus, así como otros mononegavirus, tienen una organización genómica muy ordenada. Debido a que cada gen se transcribe de manera independiente, la sustitución o adición de genes es muy conveniente.
Mientras que para los virus + ssRNA se vuelve totalmente diferente. Debido a que el genoma viral de la mayoría de los + ssRNA es un mRNA completo, todas las proteínas virales se sintetizan en un polipéptido largo, que debe procesarse en proteínas virales funcionales. Entonces + ssRNA tiene que codificar proteasas para escindir las proteínas virales. Y si las proteínas virales cambian, las proteasas pueden ser incapaces de dividirlas. La adición de IRES permite la síntesis de proteínas múltiples a partir de un único ARNm, pero cuesta más pares de bases.
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Si bien tal ventaja no parece importante para los virus, es muy útil para los humanos. Debido a que el genoma de los virus -ssRNA tolera la inserción de genes extraños, genes terapéuticos como GM-CSF, NIS, CD pueden insertarse en él. Dichos virus recombinantes pueden usarse potencialmente para tratar el cáncer. Aunque rara vez vi modificaciones similares en los virus + ssRNA o dsRNA.
Otra cosa importante es que no podemos decir que la naturaleza es torpe. Muchos virus parecen emplear una estrategia de replicación muy torpe, pero aún así son muy exitosos. Por ejemplo, los virus de ADN generalmente se replican en el núcleo de la célula, a través de la ADN polimerasa. Sin embargo, los poxvirus se replican en el citoplasma. Debido a que la ARN polimerasa solo existe en el núcleo de la célula, los poxvirus deben codificar su propia ARN polimerasa. Otro es hepadnavirus. El hepadnavirus también es un virus de ADN, pero su ADN no se copia directamente a través de la replicación del ADN, sino a través de la transcripción inversa. Entonces estos dos virus parecen ser falsos. Sin embargo, la viruela y la hepatitis B se encuentran entre las enfermedades virales más destructivas. Eso es lo que hace que la virología sea interesante.