Como dijo Ian York en su respuesta, solo debes considerar la celda como una casa. Muchos virus son ladrones que han evolucionado una clave para abrir la puerta de la casa. La membrana celular está plagada de diferentes receptores que se utilizan para unir nutrientes y hormonas. Los virus infecciosos pueden unirse a estos receptores. Los receptores exactos que se usan dependen de la célula y el virus (esta es la razón por la cual los virus pueden ser específicos del tipo de célula, si solo un tipo de célula tiene esos receptores).
A partir de ahí, depende del virus. Algunos virus simplemente inyectan su genética en la célula inmediatamente después del acoplamiento, otros son tragados intencionalmente por la célula por fagocitosis (por ejemplo, filovirus) y otros pueden ser absorbidos por la membrana celular, derramando la genética del virus en la célula (por ejemplo, VIH).
Básicamente, el virus está engañando a la célula haciendo que la célula piense que el virus es una parte regular del cuerpo y, por lo tanto, aprovecha los mecanismos preexistentes de la célula para entrar.