Existe una razón evolutiva para casi todo lo que ocurre naturalmente en el cuerpo humano, con la excepción de los genes pleiotróficos en los que cierto rasgo ocurre solo porque el mismo gen controla alguna otra función importante. En este caso, el rasgo secundario solo acompaña al viaje.
Sin embargo, en lo que respecta al ejercicio, sí, tu cerebro te recompensa por hacerlo, y por una buena razón. No solo te mantiene saludable y en forma, sino que te mantiene en forma y más capaz de luchar (o huir) de un atacante, u otras situaciones que de otro modo podrían haber llevado a la muerte de humanos ancestrales y sus antepasados.
La segunda razón por la que se me ocurre es que el ejercicio intenso provoca el desgarro microscópico de los músculos y otro daño tisular, que luego es reparado por el cuerpo y aumenta de tamaño al hacerlo (así es como los músculos se agrandan con el ejercicio, el grado Depende de tu composición genética). Dado que múltiples desgarros musculares y otras lesiones menores como el estrés intenso en las articulaciones pueden activar la vía del dolor sin que usted se dé cuenta, las endorfinas se liberan en respuesta, como lo hacen cada vez que se lastima o las vías del dolor se activan por otros medios ( por ejemplo, ¡se ha demostrado que comer alimentos picantes libera endorfinas!)