¿Por qué evolucionamos a partir de ARN basado en criaturas basadas en ADN?

Es un hecho bien conocido que el ADN actúa como un material genético en la mayoría de los organismos en este planeta tierra. Sin embargo, también está claro que el ARN también actúa como material genético, pero solo en algunos virus (por ejemplo, virus del mosaico del tabaco, bacteriófago QB, etc.). Entonces, surge la pregunta de ¿Por qué la Naturaleza Prefería el ADN sobre el ARN?

Para responder a esta pregunta, necesitamos examinar y comparar el ADN y el ARN para sus funciones:

¿Qué es mejor en Replication?

La replicación ocurre cuando una cadena actúa como una plantilla para la síntesis de nuevas cadenas complementarias. Esto es posible solo cuando existe la presencia de emparejamiento de bases complementarias entre las dos cadenas de ácidos nucleicos. Ya se sabe que el apareamiento de bases complementarias está presente tanto en los ácidos nucleicos, es decir, ADN y ARN. Por lo tanto, ambos tienen la capacidad de dirigir sus duplicaciones.

Sin embargo, el ADN tiene una ventaja en la replicación, ya que es capaz de replicar con una fidelidad muy alta porque en promedio solo se produce un error por cada 109 y 1010 bases.

¿Qué es mejor en Estabilidad?

El material genético debe ser estable para que la información genética pueda pasar de una generación a otra sin ningún cambio durante las diferentes etapas del ciclo de vida del organismo. Ahora, veamos cuál es mejor en estabilidad. ADN o ARN.

Si recordamos las dos diferencias químicas básicas entre el ADN y el ARN, entonces obtenemos estas dos diferencias:

1. La presencia del grupo 2′-hidroxilo (-OH) en el ARN.

El ARN, sin embargo, es una molécula estable ya que la presencia de carga negativa (-ve) en la cadena principal de azúcar-fosfato lo protege del ataque de los iones hidroxilo (OH-) que conducirían a la escisión hidrolítica. Sin embargo, la presencia del grupo 2′-hidroxilo (-OH) hace que el ARN sea susceptible a la hidrólisis catalizada por la base. Además, el ARN también es propenso a la autohidrólisis cuando es monocatenario. Esta reacción de escisión espontánea tiene lugar en soluciones básicas, donde los iones hidroxilo libres en solución pueden desprotonar fácilmente el grupo 2′-hidroxilo (-OH) del azúcar de ribosa.

Sin embargo, si este grupo 2′-hidroxilo (-OH) se elimina del azúcar de ribosa, entonces la velocidad de dicha hidrólisis catalizada por base se reduce aproximadamente 100 veces en condiciones extremas.

Por lo tanto, la presencia del grupo 2′-hidroxilo (-OH) en cada nucleótido de ARN lo hace lábil y fácilmente degradable.

2. La presencia de Timina en el lugar de Uracilo en el ADN.

La única diferencia estructural entre la timina y el uracilo es la presencia de un grupo metilo en la timina. Este grupo metilo facilita la reparación del ADN dañado, proporcionando una ventaja selectiva adicional.

La citosina en el ADN se desamina espontáneamente a una velocidad perceptible para formar uracilo. Por ejemplo, en condiciones celulares típicas, la desaminación de citosina a uracilo (en el ADN) ocurre en aproximadamente 107 residuos de citidina en 24 horas, lo que significa 100 eventos espontáneos por día. La desaminación de la citosina es potencialmente mutagénica porque Uracilo se empareja con adenina y esto conduciría a una disminución en los pares de bases G≡C y aumentaría en los pares de bases A = U en el ADN de todas las células. Durante el período de tiempo, la desaminación de citosina podría eliminar por completo los pares de bases G≡C. Pero esta mutación se previene con un sistema de reparación que reconoce al uracilo como extraño en el ADN y lo elimina.

Por lo tanto, el grupo metilo sobre la timina es una etiqueta que distingue a la timina de la citosina desaminada. Pero, si el ADN normalmente contiene reconocimiento de uracilo sería más difícil y el Uracilo no emparejado conduciría a cambios de secuencia permanentes ya que se emparejaron con adenina durante la replicación.

Entonces, podemos decir que Thymine se usa en lugar de Uracil en DNA para mejorar la fidelidad del mensaje genético. Por el contrario, el ARN no se repara y, por lo tanto, el uracilo se utiliza en el ARN porque es un componente básico menos costoso.

Por lo tanto, el ADN es más estable que el ARN.

¿Cuál es el más adecuado para Evolution?

Para actuar como un mejor material genético, uno debe proporcionar el alcance para los cambios lentos y graduales que se requieren para la evolución. Entre los ácidos nucleicos, tanto el ADN como el ARN pueden mutar o cambiar su secuencia. Pero, como el ARN es más inestable, muta a un ritmo más rápido y muchas pruebas sugieren un vínculo íntimo entre las mutaciones rápidas en un organismo individual y el proceso de envejecimiento y carcinogénesis, es decir, las mutaciones rápidas pueden ser carcinogénicas y conducir a un envejecimiento más rápido. Esta puede ser la razón de una vida más corta de los virus a medida que mutan y evolucionan. Mientras que el ADN sí cambia, pero a un ritmo muy lento en condiciones celulares normales que no resultan perjudiciales a largo plazo.

Por lo tanto, en la batalla anterior entre ADN y ARN, se prueba que el ADN es victorioso y se puede declarar como un mejor material genético, ya que puede

  • Replicar con más precisión.
  • Almacenar información con mejor estabilidad.
  • Se somete a cambios lentos y puede resistir los rápidos (mutaciones).

De la discusión anterior, podemos concluir que el ADN es preferido para el almacenamiento de información genética y el ARN es mejor en la transmisión de información genética.

FUENTE : ¿Por qué la naturaleza prefiere el ADN sobre el ARN?

Además de ser más susceptible a la hidrólisis, el ARN tiene un par de otras desventajas como material genético, y estas desventajas imponen restricciones significativas sobre el tamaño del genoma:

El ARN puede experimentar una migración de ramificación de 3 ‘-> 2’. Esta es realmente la misma química que la hidrólisis, excepto que el intermedio cíclico 2′-3 ‘se resuelve de nuevo a un enlace de 2′-5′, en lugar del enlace estándar de 3’-5 ‘. El enlace 2’-5 ‘interferirá con las acciones de la mayoría de las enzimas en la cadena afectada.

La otra química problemática es la desaminación oxidativa de citosina a uracilo. Esto cambiará un par de bases GC a un GU. A menos que se configure un sistema de reparación para extraer siempre el uracilo de los pares de GU y reemplazarlo con citosina, la reparación o la replicación conducirán a una tasa de mutación inaceptablemente alta.

En principio, por supuesto, el uracilo podría reemplazarse por timidina en el ARN. Pero tantos sistemas complejos e interactivos (transcripción, traducción) han evolucionado para reconocer a U, que es difícil imaginar un camino evolutivo plausible para que esto ocurra. A menudo se requieren sistemas paralelos y redundantes para la implementación de innovaciones. El ADN seguramente comenzó como un sistema paralelo de almacenamiento de información, y finalmente desplazó al ARN por completo, con la excepción de algunos virus.

El ADN y el ARN son ambos ácidos nucleicos (macromoléculas biológicas largas que consisten en moléculas más pequeñas llamadas nucleótidos).

El ADN es una molécula bicatenaria , con dos cadenas de nucleótidos que consisten en una cadena principal de fosfato, azúcar desoxirribosa, y tiene adenina, guanina, citosina y timina como bases; mientras que el ARN es una hélice monocatenaria que consiste en cadenas más cortas de nucleótidos, una cadena principal de fosfato, azúcar de ribosa y tiene bases de adenina, guanina, citosina y uracilo.

Pero quizás la diferencia más importante entre los dos es que el ADN es capaz de cambiar de forma de una manera que el ARN no puede, haciendo que el ADN sea más resistente y un depósito mejor de nuestro código genético. Específicamente, tiene que ver con los pares de bases de Hoogsteen, que es cuando uno de los ácidos nucleicos se voltea 180 grados. En última instancia, esto hace que toda la estructura de doble hélice se doble o “doble”, lo que significa que el ADN puede acomodar el daño al girar de esta manera. Las moléculas de ARN son incapaces de formar parejas de Hoogsteen, por lo que se desmoronan y se deshacen por completo cuando se encuentran con el grupo metilo que introdujo el equipo.

Si nuestros genomas estuvieran compuestos de ARN, hay muchas posibilidades de que no sean capaces de soportar el daño químico que se les inflige todo el tiempo. Parece que la capacidad del ADN para absorber el daño es una de las razones por las que evolucionamos los genomas basados ​​en el ADN.

En primer lugar porque el ARN puede funcionar como un catalizador. También está sintetizado de forma más natural. El ADN es más adecuado para el almacenamiento a largo plazo de genes. El ADN se sintetiza fácilmente a partir del ARN. Esta reacción probablemente habría sido una de las primeras en ser realizada por una ribozima. En el mundo del ARN, el ARN funcionó como la plataforma para producir catalizadores, es decir, ribozimas en lugar de enzimas, que se producen a partir de aminoácidos, es decir, son proteínas. Entonces, el mundo del ARN fue seguido por el mundo de las proteínas cuando se inventó la transformación. No veo ninguna razón para hablar de ningún mundo de ADN. El ADN probablemente se usó para el almacenamiento a largo plazo de información genética bastante temprano en el mundo del ARN. En mi opinión, fue el mundo de las proteínas el que hizo que los eucariotas completaran su configuración al agregar el citosol fuera del núcleo, que existía en el mundo del ARN. Luego vinieron organelos. Algunos de ellos viajaban, por ejemplo, para alcanzar los metabolitos necesarios, y algunos llegaron a ser tan autónomos que se convirtieron en bacterias cuando su huésped se extinguió. Otros operaron solo a nivel local. Se convirtieron en mitosomas, hidrogenosomas, mitocondrias y cloroplastos. La teoría de escape de Organelle describe esto aquí:

Conceptos erróneos en las teorías de la evolución

El ADN es más estable que el ARN. El ARN es susceptible a la hidrólisis, que básicamente es la degradación. Por lo tanto, los organismos que almacenan su información genética en el ADN deben haber sido “seleccionados” favorablemente sobre los que lo almacenan con ARN. Tenga en cuenta que todavía hay bastantes virus basados ​​en ARN (el VIH es un ejemplo).

El ADN es una modificación del ARN. Sus bloques de construcción (monómeros) están hechos en dos pasos de los de ARN.

Una enzima “ribonucleótido reductasa” convierte las partes de ribosa en partes de desoxirribosa, y otra enzima convierte las partes de uracilo en partes de timina.

ARN -> uracilo – ADN -> ADN