No hay reorganización. La región 5 ‘U3 contiene secuencias promotoras que se unen a la ARN polimerasa, y el comienzo de la región R justo aguas abajo es el sitio de inicio de la transcripción. En el otro extremo del provirus, la transcripción termina al final de la región 3 ‘R. Por lo tanto, el ARN transcrito termina con exactamente la misma estructura que el genoma de ARN viral original: R-U5-genes-U3-R
Vale la pena señalar que el genoma de ARN también tiene una tapa de 5 ‘y una cola de 3’ poli-A, al igual que un ARNm de hospedador normal, por lo que pueden actuar como plantilla para la traducción a proteínas virales y servir como genomas para los viriones recién producidos.
