¿Podemos hacer que los cursos de biología sean interesantes usando computación inspirada biológicamente?

¡SÍ! ¡Definitivamente creo que puedes! De hecho, tomé cursos con John Holland (http://en.wikipedia.org/wiki/Joh…) y Mark Newman (noté el teórico de Redes Complejas) durante mis días de estudiante en la Universidad de Michigan y tenían muchos de estos. elementos.

Los sistemas complejos y los estudios de sistemas adaptativos complejos en general, creo que son una excelente manera de fusionar cosas como la informática inspirada biológicamente con la informática:

  • Teoría de gráficos y redes complejas, con estudios de redes predadores-presas y redes ecológicas
  • Subcadena de ADN / coincidencia de subsecuencia
  • Redes neuronales: un gran punto de cruce para AI / ML y neurociencia
  • El algoritmo genético. Inspirado por la evolución, por lo que es un punto de cruce obvio entre los campos (juego de palabras muy intencionado).
  • Movimiento de insectos, como hormigas y abejas, usando simulaciones y modelos (Ver: SimAnt)
  • El juego de la vida de Conway.

Primero, los cursos de biología generalmente no son aburridos para las personas que realmente les gusta la biología. Así que supongo que estamos limitando nuestro pensamiento a los cursos introductorios de biología. En esas clases, ciertamente podría hablar sobre la computación inspirada en la biología como una aplicación de los principios de la biología, y podría hacer algo de eso en un laboratorio de curso. Dije “un” laboratorio del curso, como en una sesión, porque se supone que las clases introductorias enseñan la amplitud del tema, y ​​también hay muchos otros tipos de experimentos y técnicas para llevar a cabo.

Aquí hay algo muy importante para recordar: el estado actual del conocimiento sobre el cuerpo humano a menudo es inadecuado para predecir con precisión sus respuestas, incluso a través del modelado. Ciertamente no siempre es inadecuado, pero piense en la cantidad de medicamentos contra el cáncer que fallan. Es porque a menudo descubrimos partes adicionales de un mecanismo que no entendemos del todo. No estamos en el punto en que un hallazgo in silico se pueda tomar como un evangelio. En general, tiene que ser replicado en el organismo vivo. Esto significa que la computación de inspiración biológica, por definición, no les dará a los estudiantes una idea de cómo se hacen los descubrimientos fundamentales en las ciencias de la vida, que generalmente es a través de cuidadosos experimentos in vitro e in vivo .

No me malinterpreten, su enfoque parece ser una buena forma de que los científicos de la informática se interesen más por las ciencias de la vida, pero eso no es lo que usted pidió. Tenga en cuenta que, como biólogo / bioingeniero, el hecho de que los conceptos subyacentes del sistema inmune pueden hacer que las computadoras sean más seguras no me llena de interés apasionado, mientras que sí creo que las respuestas inmunes a los implantes médicos son geniales. Su millaje con otros puede variar.

Como se señala a continuación, esto no está relacionado con la computación inspirada en la biología, sino más bien con la forma en que se pueden realizar cursos de biología para estudiantes de informática y de ingeniería:
Este curso de Biología de Sistemas por Uri Alon (búsqueda ‘uri alon systems biology’ en youtube:
– un experto y un doctorado en física que ahora es una autoridad en biología de sistemas parece ser de interés para físicos, informáticos e ingenieros.

No he visto el video completo (o los otros videos de este curso), pero puede ser relevante para la pregunta porque su objetivo parece ser presentar una perspectiva matemática / de ingeniería / informática y abstracciones de los mecanismos biológicos.