Los bioinsuretes son seguros ya que las bacterias digieren completamente todos los desechos, sin embargo, deben mantenerse adecuadamente. algunos puntos a tener en cuenta son:
- desechos no biodegradables como botellas y plásticos no deben ser arrojados en él.
- la cantidad de bacterias (inoculam) debe mantenerse adecuadamente.
- al lavar tales inodoros se debe tener cuidado ya que los productos químicos utilizados en los biotoiletos no deben destruir los productos químicos.
- una pequeña cantidad de columna de agua se mantiene en la parte superior para evitar el mal olor en el baño.