¿Era el hombre prehistórico más rápido que un atleta de velocidad moderno?

No y por una buena razón.
Un velocista puede correr, nada más. Pobre, no es así.
El hombre prehistórico sería bueno en todo, pero no excedería en nada en particular. Como eso sería inútil para ellos. Que todavía es.

No lo sabemos, pero la respuesta es poco probable. Los atletas de hoy en día usan la ciencia de vanguardia para ir más allá de lo que los humanos podían lograr incluso hace apenas un siglo.

Lo más probable es que los humanos de hoy en día sean mucho más avanzados y capaces de cosas con las que el hombre prehistórico solo podía soñar. El hombre prehistórico no entrenó para correr. Corría como una necesidad para comer o huir de los depredadores. Aunque ciertamente tuvo que hacerlo mucho, no entrenó para la velocidad en particular.

Un atleta moderno se entrena específicamente para un fin y utiliza la sabiduría combinada de la humanidad y la ciencia para lograr ese fin mejor que nadie en la historia.

Dime qué es probablemente más rápido.

Probablemente no. Chris McDougal argumenta en su libro que el hombre evolucionó para ser un corredor de larga distancia, no un velocista.

Dicho esto, si sacas a un velocista moderno de la pista y se lo quita de los entrenadores, es probable que tenga un peor rendimiento y viceversa. ¿A quién elegirías para hándicap?