Puede cultivarlos en líquido (cultivo en caldo); esto generalmente se realiza en tubos de ensayo o matraces Erlenmeyer, utilizando la técnica aséptica adecuada. Dependiendo de las necesidades de crecimiento del organismo en cuestión, los tubos / matraces se incuban en un agitador (para la adecuada aireación del cultivo), o en crecimiento (estático).
Otra opción es cultivarlos en medios sólidos, pero usar un sustituto de agar. La gelatina, como se ha mencionado, es una alternativa común al agar. Sin embargo, no es sólido a la temperatura de crecimiento correcta para algunos organismos comúnmente cultivados como E. coli . Se realizaron algunos experimentos bastante antiguos en los que se cultivaron bacterias en secciones de patata cortadas en rodajas finas, pero este “medio” es bastante limitante en términos de qué microbios crecerán en él.