Esto ha sido respondido bastante decentemente, pero arrojaré mis 2 centavos.
Definitivamente. El genoma y la actividad de varias bacterias generalmente se relacionarán con su entorno. Usar esto para hacer predicciones se hace más fácil a medida que aprendemos más y más sobre ellas. Como ejemplo, cada vez que secuenciamos genes y genomas, la información se publica en una base de datos. Si luego encontramos estas secuencias de genes en otras muestras, podemos suponer (hasta cierto punto) que las rutas metabólicas que requieren esos genes están activas en una muestra. Entonces, si detectamos un grupo de bacterias oxidantes de amoníaco y muchas menos bacterias heterótrofas, podemos suponer que provienen de algún lugar con cantidades menores de carbono orgánico (ya que los heterótrofos necesitan carbono orgánico, mientras que los oxidantes de amoníaco no).
En términos más generales, las bacterias tienen diferentes tolerancias para el pH, la acidez e incluso la luz. Identificar las bacterias que cumplen estos nichos dará una indicación de esto. Sin embargo, en la práctica generalmente, en cambio, tratamos de cultivar bacterias replicando las condiciones en que las encontramos.
Finalmente, esto es en parte cómo podemos analizar el agua potable: si encontramos E. coli en el agua potable, asumimos que la materia fecal ha ingresado en la vía fluvial, ya que la bacteria generalmente proviene del intestino de los organismos y no disfruta habitualmente de la vida agua.
