Creo que preguntas como esta se responden mejor con Google:
Las amebas no forman un solo grupo taxonómico; en cambio, se encuentran en todos los linajes principales de organismos eucarióticos. Las células ameboides ocurren no solo entre los protozoos, sino también en los hongos, las algas y los animales.
https://en.wikipedia.org/wiki/Am…
El término “ameba” se refiere a una célula capaz de alterar su forma a través de la extensión o retracción de pseudópodos, en lugar de a una agrupación taxonómica específica.
Con referencia específica a su pregunta, las amebas pueden ser hongos, pero ni bacterias ni virus.