¿Por qué usamos 16S rRNA para identificación bacteriana y no 5S o 23S?

Las bacterias tienen tres tipos de ARNr; 5S, 16S y 23S. Hay más de una copia de ARNr presente en las bacterias. r significa ribosomal. Cada unidad de ribosoma tiene una subunidad pequeña y una subunidad más grande. Los rRNA 5S y 23S están presentes en la subunidad grande. 16S rRNA está presente en la subunidad más pequeña.

  • Todos los tres tipos de rRNA se pueden usar para la identificación.
  • 5S rRNA es demasiado pequeño (aproximadamente 120 bp) para ser confiable para la identificación y para estudiar la relación filogenética. Por lo tanto, no se usa.
  • El ARNr 16S ha sido ampliamente estudiado y está bien caracterizado. Por lo tanto, se usa actualmente. Tiene una región conservada y una región variable. Los cebadores universales están diseñados para que la región conservada amplifique la región variable para la determinación de la secuencia.
  • Estoy seguro de que en el futuro, el ARNr 16S será obsoleto y los científicos utilizarán otras técnicas.

Tal vez un “punto de inflexión”. El valor de 16S aumenta debido a la gran cantidad de datos acumulados con los que se puede comparar la información nueva.