Es un proceso anaeróbico. La munición es el paso del ciclo de nitrógeno.
Paso 1- Fijación de Nitrógeno: bacteria especial llamada Diazotrophs, ej. Azotobacter , Rhizobium que tiene enzima nitrogenasa que convierte el nitrógeno en amoníaco para ser utilizado por las plantas.
Paso 2- Ammonificación: El nitrógeno orgánico se convierte en ion de amonio. Las enzimas involucradas son GS, GOGAT, GDH, etc.
Paso 3- Nitrificación: los iones de amonio se convierten en iones de nitrato
Paso 4 – Desnitrificación: los compuestos simples de nitrógeno se convierten en iones de nitrógeno que se liberan a la atmósfera.