Cómo identificar bacterias en el barro

Con considerable dificultad. La mayoría de los sistemas de identificación que se utilizan para las bacterias se han diseñado para bacterias de organismos médicos (incluidos veterinarios) o aquellos de importancia comercial. Existen algunos sistemas relacionados con plantas, principalmente patógenos de plantas y organismos metabólicamente importantes, como los que fijan el nitrógeno.
El lodo contiene una variedad de bacterias
1. Contaminantes, por ejemplo, organismos fecales
2. Bacterias de ecosistemas acuosos: lo que hay dependerá de dónde provenga el agua, piense en fuentes termales, ríos, etc.
3. ‘Bacterias del suelo’ – ¿qué suelo? Humus, suelo del jardín, suelo del suelo del bosque (tropical o templado) etc. cada uno tendrá organismos únicos.
Como un estudio de alcance, para que comiences, decide tu muestra de suelo y extrae el rRNA 16s. Desde allí, amplificación, separación y secuencia y comparar con la base de datos existente. Este es un proyecto importante.

Bibek Ray da buenos consejos para comenzar. Una vez que haya colonias puras individuales creciendo, puede comenzar la identificación. Necesitarás acceso a un laboratorio equipado y tal vez una certificación de seguridad, dependiendo de lo que tengas. Históricamente, la mayoría de las identificaciones se basaban en una serie de pruebas bioquímicas que proporcionarían un conjunto único de resultados para cada especie. Hoy en día puede hacer gran parte de él mediante la secuenciación del ADN de genes clave.