Como con muchas de tales generalizaciones, depende. El acto de elegir una sola colonia es selectivo y, a medida que se desarrolla un procedimiento, se aíslan las cepas individuales.
Si se trabaja con una cepa pura, lo mejor es sacar del césped para inocular y experimentar, pero para descartar el inóculo y asegurarse de que sea puro. Las dificultades que pueden resultar de las colonias individuales se ilustran mejor con estudios sobre la resistencia a los antibióticos. Una sola colonia puede haberse revertido (pérdida de resistencia). En tales estudios, es habitual utilizar un inóculo de césped tomado de un medio que contiene el antibiótico para asegurar el mantenimiento de la resistencia.
En lugar de recolectar colonias, puede ser mejor preparar un gran lote de inóculos a partir de la mancha pura y almacenarlos para usarlos en el futuro (por ejemplo, en perlas en nitrógeno líquido).
Al igual que con todos estos consejos “depende del estudio”, el procedimiento adoptado debería ser tal que garantice que se utilice la misma cepa en todos los experimentos.