Sí. (Supongo que estamos hablando de seres humanos [XX] genéticamente femeninos).
Los humanos genéticamente hembras no tienen un cromosoma Y No puede heredar un cromosoma de sus padres si no lo tienen. Por lo tanto, la progenie biológica de dos hembras XX sin Y sería una hembra Y de menos XX, con una X heredada de cada progenitor.
No es tanto que el cromosoma Y “se vuelva inexistente” como que nunca haya un cromosoma Y en esa familia desde el comienzo (suponiendo que logren mantener a todos los hombres alejados de sus hijas para siempre, una estrategia que no tiene una buena historia de éxito).