Las bacterias sondean el medio ambiente de varias formas complementarias; las proteínas sensoriales producidas constitutivamente incrustadas dentro de sus paredes celulares detectan cambios fisicoquímicos en la pared celular y el medio ambiente, estas son comúnmente vías de transducción de señal de 2 componentes y regulan la expresión de un conjunto de genes (llamado regulón) en respuesta a una señal.
Las moléculas de detección de quórum (por ejemplo, indol y ppGpp) se utilizan para la comunicación de célula a célula. Indole actúa para inhibir la división celular (Indole previene la división celular de Escherichia coli mediante la modulación del potencial de membrana) y la formación de biopelículas, también regula la motilidad celular. Cuando la concentración de indol es alta; la división celular se ralentiza y las bacterias pasan de vivir dentro de las biopelículas a la vida planctónica (Indole afecta la formación de biofilm en las bacterias). En este sentido, las moléculas que detectan el quórum son utilizadas por las bacterias para determinar la densidad de población y la salud de sus vecinos.
