¿Qué determina las tasas de mutación de una cepa viral en particular?

De una cepa particular? Una “cepa” es típicamente una descripción más detallada de un virus con algunas pequeñas variaciones (por ejemplo, hay diferentes cepas de gripe pero todos son virus de la gripe). Dado un tipo de virus, las cepas suelen tener tasas de mutación que son aproximadamente iguales. Dicho esto, amplias categorías de virus tienen diferentes tasas de mutación. Por ejemplo, los virus de ADN tienen tasas de mutación mucho menores que los virus de ARN (tan bajas como [math] 10 ^ {- 8} [/ math] mutaciones por bp por generación para virus de dsDNA y tan altas como [matemáticas] 10 ^ {- 4 } [/ math] para virus de ARN).

Si bien la tasa de mutación precisa parece estar bajo restricciones selectivas *, particularmente cuando las tasas de mutación son altas, el razonamiento detrás de la diferencia entre las tasas de mutación de ARN y ADN es principalmente bioquímico. Las polimerasas virales de ARN son considerablemente más propensas a errores que las ADN polimerasas.

Las variantes de alta fidelidad de los virus de ARN se han aislado en los laboratorios (no creo que haya sucedido en la vida real), lo que sugiere que la evolución de una menor tasa de mutación es al menos posible, aunque no parece ocurrir. Estas variantes a menudo son superadas por virus de tipo salvaje, pero precisamente por qué no está claro.

Creo que las presiones selectivas sobre las tasas de mutación viral (particularmente cuando juega con el concepto de ‘robustez’ de la población) [1] son ​​una pregunta realmente interesante, pero el determinante principal de la tasa de mutación es definitivamente el tipo de polimerasa que se usa.

* Las personas discuten si las altas tasas de mutación en los virus de ARN en realidad confieren un beneficio de adecuación versus el simple hecho de usar una ARN polimerasa rápida.

Notas a pie de página

[1] http://www.nature.com/nrmicro/jo…