Para entender la respuesta, debes conocer el principio detrás de la tinción de Gram. Las células Gram negativas pierden la mancha primaria de cristal violeta después de la etapa de decoloración. La razón es que, las células Gram negativas tienen una membrana externa compuesta de lipopolisacárido. En presencia de un 95% de alcohol (tercera etapa de tinción de Gram), la porosidad de la capa de lipopolisacárido aumenta y toda la tinción primaria se exuda. Y la celda toma la contra tinción.
La cianobacteria tiene muchas capas fuera de la membrana celular como se ve en la figura. La capa más externa es la capa de baba, seguida por la cápsula, la cubierta mucoide, la membrana externa y luego la capa de peptidoglicano.
Entonces el mismo principio se aplica incluso para las cianobacterias.
Otro punto que me gustaría hacer es que la capa de la cápsula tiene poca afinidad por las manchas. Entonces, cuando agregamos la tinción primaria, cristal violeta y mordiente, la célula cianobacteriana no absorbe la mancha. En el siguiente paso agregamos alcohol (es decir, el decolorante). Este alcohol aumenta la porosidad de las membranas externas de cianobacterias. Por lo tanto, cuando agreguemos la contratinción, es decir, saffranine. Toma ese color y parece rosa. (Puedo estar equivocado con este segundo punto).