Las bacterias que ayudan a lograr funciones corporales normales (también conocidas como bacterias que no son patógenas) se consideran parte de la “flora humana normal”. Hay “hábitats” en miniatura en nuestra piel y dentro de nuestro tracto digestivo y en muchas otras áreas. Las bacterias que viven en estos hábitats que nos proporcionan efectos beneficiosos se considerarían “buenas bacterias”. El problema surge cuando las bacterias que no forman parte de nuestra flora normal comienzan a habitar en nuestra piel o intestinos en cantidades que superan a las bacterias útiles que ya están presentes en nuestros cuerpos. Un buen ejemplo es una infección de levadura. Las bacterias que causan las infecciones por hongos son “oportunistas”, lo que significa que pueden volverse patógenas si las condiciones son las correctas. Estas bacterias ya existen en la piel de los humanos, pero si el pH cambia y permite que la bacteria prolifere, lo hará.
Esta es la razón por la cual las personas con antibióticos a largo plazo generalmente aumentan de peso, porque si bien interrumpe las bacterias dañinas que unen nuestro cuerpo, el metabolismo corporal normal también se ve afectado porque las bacterias que generalmente ayudan a descomponer los alimentos consumidos también son eliminados por los antibióticos.