Un patólogo generalmente observará la estructura del tejido para determinar si se ve saludable o si se desvía de lo esperado para ese órgano. Para la mayoría de las formas de tumores hay áreas que son más altamente diferenciadas, es decir, que se observan más de cerca del tejido sano del que provienen, que generalmente le permitirán adivinar el origen del tumor.
Un tumor a menudo se clasifica y, dependiendo del tipo, existen diferentes esquemas, como la puntuación de Gleason para el cáncer de próstata y la puntuación de Elston para los cánceres de mama. Estos intentan clasificar el tumor desde altamente diferenciado (conserva más características del tejido originario) hasta poco diferenciado (conserva muy pocas características).
Esto luego permite al patólogo teñir los portaobjetos con diferentes anticuerpos que se dirigen a las proteínas, a menudo proteínas estructurales, que se expresan en los tejidos de los que probablemente proviene el cáncer.
También puede haber tinción adyuvante en cuanto a proteínas específicas tales como PSA en cáncer de próstata o estado de HER2 / ER / PR en cáncer de mama, hacer análisis moleculares de ciertas mutaciones genéticas y MIB-1 para el recuento mitótico.
Con base en los resultados de estas pruebas, el patólogo hará un diagnóstico de cáncer e indicará el origen más probable del tumor y las características de ese tumor, que pueden influir en la elección del tratamiento.