¿Cómo se clasifican las eubacterias y las arqueobacterias?

Las eubacterias y las arqueobacterias pueden clasificarse según su metabolismo, fisiología y según su genoma. Las arqueobacterias son extremófilos y, como tales, se clasifican según el entorno extremo en el que colonizan, como el entorno hipersalino (halófilos), los productores de metano (metanophilus) y los termófilos. Las eubacterias también se clasifican en función de su fisiología (es decir, las propiedades de la pared celular), el metabolismo, el potencial redox (aerobios y anaerobios), así como el genoma. A diferencia de las arqueobacterias, es más fácil clasificar las eubacterias en función de la fisiología y el metabolismo. La clasificación relacionada con el metabolismo prueba la composición bioquímica del organismo en sí.