Las proteasas catalizan la descomposición de las proteínas contaminantes presentes en la solución a sus aminoácidos componentes. También degrada cualquier nucleasa y / o enzima que pueda estar presente en la muestra. Esto es de vital importancia ya que estos compuestos químicos pueden atacar y destruir los ácidos nucleicos en su muestra.
La proteinasa K es una enzima que escinde el enlace peptídico en proteínas junto al grupo carboxilo de residuos de aminoácidos hidrófobos (alifáticos y aromáticos). La proteinasa K en sí misma es una proteína, pero es resistente a la desnaturalización por calor, detergentes y sales caotrópicas y continuará funcionando felizmente en ellas siempre que la temperatura / concentración no sea demasiado alta. Es estable (y funcional) hasta 65 grados C y funcionará en temperaturas de hasta 25 grados C (temperatura ambiente). A menudo se usa a temperaturas más altas (50-65 grados C) porque la mayoría de las nucleasas que mastican su ADN se desnaturalizan / inactivan a estas temperaturas.
