¿El MHC2 al que las células B y T se deben unir para poder activarse tiene el mismo péptido unido a ellas?

No, en absoluto. La Bcell debe procesar el mismo antígeno que la célula T reconocerá, pero de ningún modo la Bcell reconoce los mismos epítopes. Un Bcell reconocerá estructuras similares a las secundarias y terciarias en el contexto del antígeno que encuentre ofensivo en el medio natural. Toda la estructura será reconocida. Una vez que este antígeno es fagocitado, se descompone en secuencias individuales de la proteína, y éstas se presentan a la célula T. El Tcell reconoce secuencias, el Bcell reconoce la estructura. Son contextos completamente diferentes, por lo que no pueden ser lo mismo.