¿Qué proteínas son universales?

La proteína de síntesis de ADN principalmente, supongo, pero sé que existe una variación. Quiero decir, las proteínas no son exactamente iguales entre especies, incluso si tienen la misma estructura, función, nombre. Siempre hay pequeñas diferencias, de unos pocos aminoácidos.

¿Qué grado de similitud espera? 100%?

el metabolismo de organismos muy diferentes se basa en los mismos compuestos bioquímicos complejos. La proteína citocromo c, esencial para la respiración aeróbica, es uno de esos compuestos universales. La universalidad del citocromo c es evidencia de que todos los organismos aeróbicos probablemente descienden de un ancestro común que usó este compuesto para la respiración. Ciertas proteínas sanguíneas que se encuentran en casi todos los organismos dan evidencia adicional de que estos organismos descendieron de un ancestro común. Dichos compuestos bioquímicos, incluidos el citocromo c y las proteínas sanguíneas, son tan complejos que es poco probable que compuestos casi idénticos hayan evolucionado independientemente en organismos muy diferentes. Estudios adicionales del citocromo c en diferentes especies revelan variaciones en la secuencia de aminoácidos de esta molécula. Por ejemplo, el citocromo c de monos y vacas es más similar que el citocromo c de monos y peces. Tales similitudes y diferencias sugieren que los monos y las vacas comían más estrechamente que los monos y los peces. Los científicos han comparado de manera similar la bioquímica de las proteínas sanguíneas universales. Sus estudios revelan evidencia de grados de relación entre diferentes especies. Esta evidencia implica que algunas especies comparten un ancestro común más reciente que otras especies. De tal evidencia, los científicos han deducido las relaciones evolutivas entre diferentes especies de organismos. @@@

fuente:
http://bioweb.cs.earlham.edu/9-1

El código genético “universal”
La evolución tiene sentido de homologías
Membrana de plasma

fuente:
http://www.zoology.ubc.ca/~bio33

paralogy

http://www.plosone.org/article/i
http://cgd.jax.org/datasets/clus