Las bacterias son organismos procariotas unicelulares, y los hongos son eucariotas, y pueden ser organismos unicelulares o multicelulares complejos. La composición de sus paredes celulares es diferente (azúcares, lípidos, etc.) y el modo de replicación, por lo que se necesitan diferentes sustancias químicas para interrumpir ese proceso.
La marchitez bacteriana es causada por Erwinia tracheiphila, una bacteria gramnegativa de la familia Enterobacteriaceae. El vector infectante parece ser el escarabajo del pepino que alberga E. tracheiphila en su intestino. Para erradicar el vector es necesario aplicar un insecticida de aplicación sucia así como uno aplicado a la planta.
