¿La perforación en el océano subterráneo de Europa causaría un daño significativo a cualquier ecosistema potencial allí? (Al igual que la radiación solar y los microbios extraños)

Si el barco y su equipo están debidamente esterilizados de antemano (lo serán), no veo ningún riesgo real de contaminación microbiana. O bien no habría ninguno en la superficie o cerca de ella (probable), o cualquier cosa que probablemente también esté adentro.

La radiación solar no penetraría de manera significativa desde un pequeño agujero temporal. Ahora, agregue que estamos en Júpiter, se está volviendo bastante despreciable (el agua es un gran escudo de todos modos, incluso en la tierra la luz del sol solo entra en el agua unos cientos de pies).

Júpiter produce mucha radiación. Esto es más relevante allí. Aún así, un pequeño agujero temporal no va a hacer nada.