¿Por qué los virus no mutan lejos de los PAMP?

Da un paso atrás por un segundo y considera cuáles son los PAMP virales en realidad . Con algunas excepciones, los PAMP virales son básicamente ácidos nucleicos. Los receptores de reconocimiento de patógenos, o PRR, se activan al detectar “patrones” como ss / dsRNA o DNA en el citoplasma. La idea con el reconocimiento PAMP es que busca patrones que literalmente no se pueden cambiar.

Tiene razón en que los virus mutan mucho más rápido que los PRR (que, a todos los efectos, no cambian). Pueden cambiar mucho y existe una intensa presión selectiva para evitar el reconocimiento de PRR, pero realmente no hay forma de que un virus deje de usar ácidos nucleicos. Simplemente no hay forma de mutar lejos de los PAMP y ese es el punto. No sería un PAMP útil si no estuviera muy conservado.

Quizás podría preguntar por qué todos los virus no son virus ssRNA. Generalmente, el ADN citoplásmico y el ARNdc son más inmunogénicos que el ARNss, entonces ¿por qué no todos los virus dejan de usar ADN? Esta es otra característica crucial de los PAMP, aunque es más relevante para otros tipos de patrones (como LPS). Incluso si existe una forma potencial de cambiar, los PAMP a menudo están profundamente arraigados en el ciclo de vida de un patógeno. Un virus de ADN realmente no puede convertirse en un virus de ARN y hay maneras mucho más simples de lidiar con el reconocimiento que cambiar radicalmente todo su ciclo de vida.

En lugar de mutar lejos de los PAMP, es mucho más fácil para los virus evitar la detección por otros medios. Estas estrategias varían, pero lo que me gusta llamar estrategias de “disparar al mensajero” son bastante comunes y efectivas. Si no puedes evitar que te reconozcan, también podrías parar lo que te reconozca. Por ejemplo, la gripe produce una proteína llamada NS1 que inhibe la señalización de RIG-I. El VHS y el adenovirus tienen estrategias para bloquear la activación de PKR. Algunos virus producen análogos de IFN que pueden interferir directamente con la señalización de IFN, que es el objetivo final de prácticamente toda la activación de PRR.

En conclusión, los virus no mutan lejos de los PAMP porque simplemente no es posible (normalmente). Es más fácil evadir el reconocimiento inmunológico con otras estrategias.