¿Cómo obtuvo Craig Venter el genoma de M. mycoides de una computadora, donde se encontraba como 0s y 1s, EN el citoplasma de una célula, en el mundo “físico”?

De la misma manera que obtienes cualquier cosa desde una computadora en el mundo real. Una máquina o una persona interpreta los comandos dados por la computadora y hace algo. En este caso, era un sintetizador de ADN. Los sintetizadores de ADN básicamente toman algunos químicos y los unen de manera definida para producir una molécula de ADN con una secuencia específica, llamada oligo.

Sin embargo, la síntesis de ADN produce muchos errores, por lo que para corregir esos errores, juntan muchos de los oligos en un fragmento de ADN bicatenario y lo colocan todo en una bacteria. Las bacterias son mucho mejores en la replicación de ADN que nuestras enzimas de tubo de ensayo, y por lo tanto, se esperarían muchos menos errores. Después de la extracción de una cepa bacteriana, analizaron las cadenas de ADN para asegurarse de que la bacteria tuviera lo que los científicos necesitaban. Estos fragmentos tenían alrededor de 500 pares de bases, por lo que hubo que trabajar mucho para hacerlo más grande.

Entonces, los científicos comenzaron a ciclar entre poner más fragmentos juntos y meter eso en bacteria. Una vez que los fragmentos eran demasiado grandes para la bacteria, se transfirieron a células de levadura, donde se completó y se secuenció el genoma completo final.

Con el fin de obtener su genoma sintético en una célula final, mataron el interior de una célula relativa y colocaron el ADN de su cepa de levadura en las células. Algunos de ellos “arrancaron” con su genoma sintético y comenzaron a trabajar.

No es tan interesante como sacar directamente de la computadora a un ser vivo porque se aprovechan de tantas celdas diferentes, pero sigue siendo un paso en la dirección correcta.

Ver Centro Nacional de Información Biotecnológica , documento PNAS Generación de un genoma sintético por ensamble de genoma completo: bacteriófago X174 a partir de oligonucleótidos sintéticos (Hamilton O. Smith, Clyde A. Hutchison, III, Cynthia Pfannkoch y J. Craig Venter, 2003-12-23 )