Cilia y Flagella son organelos que ayudan en el movimiento de un organismo.
Los cilios son cortos, y generalmente muchos en número por célula. Se mueven muy rápido exhibiendo movimiento rotatorio. Los cilios se encuentran en células eucariotas.
Por otro lado, los flagelos son más largos e inusualmente menores en número por célula. A veces, incluso 1 flagelo está presente por célula. Son de movimiento lento en comparación con los cilios que muestran un movimiento ondulatorio. Los flagelos se encuentran en células procariotas y eucariotas.