¿Es posible descubrir la (s) mutación (es) que convirtieron a las bacterias anaeróbicas en aeróbicas en el momento de su evolución?

Es una apuesta segura que la mutación en cuestión fue una duplicación parcial o completa del genoma. La diversidad y la falta de homología obvia (que no sean patrones de mosaico desconcertantes) entre las variantes de las vías glucolíticas eubacteriales y arcaicas sugieren que varios clados diferentes han desarrollado sus propias versiones de glicólisis aeróbica de forma independiente, y las variantes en circulación son el resultado del intercambio genético .

En euks, la situación es un poco menos confusa y los principales eventos que conducen a su adquisición de la glucólisis aeróbica se pueden hipotizar con mayor certeza.

La ruta glucolítica de Trimastix pyriformis es un mosaico evolutivo

Evolución de la fermentación aeróbica – Wikipedia

Creo que en teoría, sí. Lo mejor de la ciencia evolutiva es que te da un camino hacia el comienzo.