¿Todas las bacterias contienen cas9?

Cas9 (proteína asociada a CRISPR 9) es una endonucleasa de ADN guiada por ARN asociada con el sistema de inmunidad de adaptación tipo II CRISPR (Clustered Regularly Interspaced Short Palindromic Repeat) tipo II en Streptococcus pyogenes, entre otras bacterias. S. pyogenes utiliza Cas9 para interrogar y escindir ADN extraño, tal como ADN de bacteriófago o plásmido invasor.

Lineagei taxonómico

organismos celulares> Bacterias> Grupo de terbacterias> Firmicutes> Bacilos> Lactobacillales> Streptococcaceae> Streptococcus> Streptococcus pyogenes

Cuando revisé la secuencia de Cas9, se deriva principalmente de E. coli, Sterptococcus pyogenus y Lactobacilli, lo que indica que puede no estar presente de forma ubicua en todas las bacterias. (en mi limitado conocimiento)

Aparentemente no, y aquí hay una hipótesis de por qué: Los principales linajes bacterianos están esencialmente desprovistos de sistemas de defensa viral CRISPR-Cas

Los sistemas CRISPR-Cas que confieren microorganismos con inmunidad frente a virus están presentes en solo el 10% de los 1.724 microorganismos muestreados, en comparación con los informes anteriores de un 40% de presencia en bacterias y un 81% en arqueas. Atribuimos esta gran diferencia a la falta de sistemas CRISPR-Cas en los principales linajes bacterianos que no tienen representantes cultivados. Correlacionamos la ausencia de CRISPR-Cas con la falta de capacidad de biosíntesis de nucleótidos y un estilo de vida simbiótico. Los sistemas de restricción están bien representados en estos linajes y podrían proporcionar tanto defensa viral no específica como acceso a nucleótidos.

No todas las bacterias contienen cas9. Cas9 se encuentran en aproximadamente 40% del genoma bacteriano secuenciado y 90% de las arqueas secuenciadas (Grissa I, Vergnaud G, Pourcel C (mayo de 2007). “La base de datos CRISPRdb y herramientas para visualizar CRISPRs y generar diccionarios de espaciadores y repeticiones”) .

Entiendo que casi todas las arqueas y aproximadamente la mitad de las bacterias contienen el sistema de defensa CRISPR-Cas. (Lillestol y otros 2006, Marraffini & Sontheimer, 2010)