¿Por qué dejamos de existir cuando partes de nuestro cuerpo permanecen funcionales y completamente intactas? ¿Qué nos hace a nosotros? ¿Hay un órgano en particular que sea equivalente al alma? ¿En qué punto se cruza la barrera de la muerte?

Yo diría que si no eres consciente, entonces no eres el “yo normal” en el sentido de que puedes interactuar con las personas y el mundo. Dado que esa consciencia tiene lugar en el cerebro, esa es probablemente la cosa más parecida a un alma que vas a encontrar. Si no hay esperanzas de que vuelvas a estar consciente de nuevo, es posible que te consideren con muerte cerebral, y luego otras personas tengan que decidir cuándo “desconectar” la máquina que mantiene las otras partes con vida.

No sé si estabas buscando algo más “médico” que eso. Pero aquí hay más detalles: Muerte cerebral – Wikipedia