Las células procariotas que residen en el cuerpo humano se denominan microbiota humana. Residen en o dentro de cualquiera de una serie de tejidos humanos y biofluidos, incluyendo la piel, las glándulas mamarias, la placenta, el líquido seminal, el útero, los folículos ováricos, los pulmones, la saliva, la mucosa oral, la conjuntiva y el tracto gastrointestinal.
Los humanos están colonizados por muchos microorganismos; la estimación tradicional es que el cuerpo humano promedio está habitado por diez veces más células no humanas que células humanas, pero las estimaciones más recientes han reducido esa proporción a 3: 1 o incluso a aproximadamente el mismo número.
