¿Es verdad que el cromosoma Y en humanos / mamíferos puede resultar ser un cromosoma X durante ciertas mutaciones?

No, pero hay circunstancias en las que un XY genético puede ser un XX fenotípico (genéticamente masculino, pero con apariencia completamente femenina), el más común es la Insensibilidad Androgénica Congénita. En este síndrome, el cuerpo produce hormonas masculinas, pero no tienen un efecto sobre la apariencia. La forma física por defecto de un mamífero es femenina, los andrógenos son la señal que le dice a un embrión en desarrollo que cambie a macho. Debido a que incluso las mujeres producen algunos andrógenos normalmente, los niños CAI a menudo son hiperfemeninos, y no se reconoce que sean diferentes a las niñas normales hasta la pubertad o más tarde, cuando las cosas relacionadas con el sistema reproductivo se vuelven un poco raras.

No. El cromosoma Y humano tiene muy pocos genes. El cromosoma X lleva más de 1,000. No puedes cambiar algo que no está allí.