Las bacterias anaeróbicas pueden sobrevivir como esporas en un ambiente oxigenado. No pueden hacer nada más que esperar a que el oxígeno desaparezca, luego vuelven a la vida y comienzan a metabolizar. Lo contrario también es cierto, si el oxígeno se vuelve repentinamente presente.
Si las aguas residuales sometidas a la respiración aeróbica se vuelven anaeróbicas, toda la batería aeróbica morirá o formará esporas, y se desarrollarán las esporas anaeróbicas y comenzará la digestión anaeróbica.