¿Qué puedes usar para la selección de bacterias además de la resistencia a los antibióticos?

Depende de lo que quiere decir con “selección”.

Algunos otros comentaristas están hablando de selección para distinguir diferentes especies. Esto se hace a menudo colocando su cultivo en “medios selectivos” que contienen ingredientes que favorecen el crecimiento de ciertas bacterias pero no de otras. Además, hay “medios diferenciales” que pueden cambiar de color dependiendo de lo que está creciendo.

Sin embargo, menciona el uso de resistencia a antibióticos para la selección.

Parece que está transformando vectores plasmídicos en bacterias y desea seleccionar solo aquellos en los que esto tuvo éxito.

En esa situación, el vector plasmídico puede contener el gen AmpR para resistir la ampicilina. Entonces, las bacterias que se transformaron con éxito (ahora tienen el plásmido) pueden sobrevivir en una placa de ampicilina, mientras que todos los demás mueren. (Hay variaciones usando otros antibióticos).

Un método más específico es “cribado azul-blanco”. Esto es especialmente útil si ha empalmado una nueva secuencia de inserción en el plásmido.

El resultado final será colonias codificadas por colores, para que pueda ver cuáles tienen el plásmido recombinante (con su inserto).

El problema es que esta evaluación debe realizarse solo después de que haya utilizado la selección de antibióticos (de lo contrario, estaría sobrecargado de colonias blancas falsas positivas).

Algunas personas están trabajando en alternativas totalmente libres de antibióticos, pero son nuevas, complicadas y probablemente caras.

Introducción al cribado azul-blanco

Plásmidos 101: cribado azul-blanco

5 maneras de seleccionar clones recombinantes

Nueva generación de cadenas principales de plásmidos carentes de marcador de resistencia a antibióticos para ensayos de terapia génica

Selección sin antibióticos en bioterapéuticos: ahora y para siempre

Cualquier factor ambiental o competitivo. pH, comida, agua, temperatura, organismos competidores o depredadores.

Podría, por ejemplo, hacer un experimento a largo plazo en el que infecte las placas bacterianas con el virus del fago y vea qué tipo de mutaciones confieren resistencia. O secarlos. O calentarlos. Casi cualquier cambio ambiental que algunos fenotipos sobrevivan mejor que otros es una “presión selectiva”.

Puedes usar lo que quieras
¿Qué pasa con los factores de estrés químico? como alto / bajo en sal? alta concentración de un contaminante? capacidad de prosperar en un sustrato particular? ausencia o presencia de oxígeno? …
¿Qué hay de los factores físicos? ¿Alta temperatura? ¿baja temperatura? ¿alta presión? ¿baja presión? alta luminosidad? ¿desecación? presencia de radiactividad?
¿Qué hay del estrés biológico? presencia de depredadores como otras bacterias o protozoos? presencia de bacteriófagos? otras bacterias concurrentes?

¿Qué hay de elegir las bacterias a mano en función del color de su colonia?

La selección puede ser tan diversa como te puedas imaginar.

En general, la capacidad de crecer en un medio definido. Diferentes cepas de bacterias tienen diferentes requisitos nutricionales, de temperatura y de oxígeno.

Las mutaciones y la transformación también pueden ser causadas por radiación y sustancias químicas nocivas

En algunos casos, las bacterias pueden adaptarse y metabolizar las toxinas ambientales.