¿Pueden los humanos usar otra fuente de energía (par de bases) además del ATP?

En realidad lo hacemos, GTP está involucrado en la transferencia de energía dentro de la célula. Por ejemplo, una molécula de GTP es generada por una de las enzimas en el ciclo del ácido cítrico. Esto es equivalente a la generación de una molécula de ATP, ya que GTP se convierte fácilmente en ATP.
Además, GTP es la fuente de energía utilizada para fabricar proteínas. Página en Nih

El cuerpo humano usa los otros nucleósidos trifosfatos como fuente de energía

GTP se usa para la gluconeogénesis y la síntesis de proteínas

CTP se usa para el metabolismo de los lípidos

UTP se utiliza para la síntesis de glucógeno