Los mecanismos para reducir la mutación en bacterias no son tan diferentes de los eucariotas (por ejemplo, la corrección de ADN y la actividad de exonucleasa). Las tasas de mutación son más altas en las bacterias. Pero incluso entonces, el número promedio de mutaciones en la mayoría de las bacterias es mucho menos de 1 por generación.
Sin embargo, mucho más importante es el equilibrio de selección-mutación, que es un fenómeno a nivel de la población. Las bacterias se reproducen en cantidades tan grandes que la selección natural supera los efectos nocivos de la mutación.
De hecho, debido a la baja o la falta de recombinación, la mutación es esencial para generar variación en las bacterias. Por otro lado, una de las razones por las que las bacterias (y otras especies clonales) no necesitan recombinarse tanto es probable porque sus poblaciones altas dan como resultado un alto número efectivo de mutaciones.
