Hasta ahora, solo se sabe que los bacteriófagos (virus que infectan a las bacterias) contienen genomas hechos de:
ADN bicatenario (dsDNA) – Virus en el orden Caudovirales o familia Corticoviridae
DNA monocatenario (ssDNA) – Virus en las familias Microviridae o Inoviridae
RNA de cadena simple de sentido positivo (+ ssRNA) – Virus en la familia Leviviridae
ARN bicatenario (dsRNA) – Virus en la familia Cystoviridae
Sin embargo, esta anotación da una falsa impresión de cuántas especies se encuentran realmente en estas categorías. La mayoría de los bacteriófagos conocidos son dsDNA o ssDNA (> 2,000 especies). Hay muchos menos virus conocidos + ssRNA (~ 11 especies) o dsRNA (8 especies).
Dicho esto, sería incorrecto decir que estos son los únicos tipos de virus que pueden infectar a las bacterias. Los bacteriófagos han sido ignorados en gran medida en los últimos 20 años de investigación sobre virus, incluidos intentos de descubrimiento de bacteriófagos nuevos y diversos. Es probable que haya muchos más bacteriófagos de ARN, incluidos los que tienen genomas de ARNss y virus de retrotranscripción, pero aún no se han descubierto.