¿Hay alguna parte vestigial a nivel celular o inferior?

Por supuesto. Los pseudogenes son restos de tramos de ADN previamente funcionales que ya no codifican las proteínas. Por ejemplo, el hecho de que el gen se relacione también con el esmalte se ha convertido en un pseudogen en ballenas y osos hormigueros. Ambos carecen de dientes.

Ver Losing Teeth, pero Keeping Genes por Carl Zimmer.

Sí..

También existen estructuras moleculares vestigiales en humanos, que ya no se usan, pero que pueden indicar ancestros comunes con otras especies. Un ejemplo de esto es un gen que es funcional en la mayoría de los otros mamíferos y que produce L-gulono lactoneoxidasa, una enzima que puede producir vitamina C. Una mutación documentada desactiva el gen en un antecesor del moderno orden infra de dineros y simios ahora permanece en sus genomas, incluido el genoma humano, como una secuencia vestigial llamada pseudogen

Sí, incluso a nivel genético. Muchas hebras de cromosomas ya no tienen mucho efecto en nuestro genotipo. Las combinaciones químicas simplemente no afectan a nuestro fenotipo biológico.

Lo más fácil de entender sería verificar: Vestigialidad – Wikipedia