A pesar de que esta pregunta es imposible de responder en su estado actual, de todos modos la voy a analizar. (Me reservo el derecho de editar mi respuesta, así como la exclusión de snark, en un momento posterior).
¿Te refieres a proteínas como en los mensajeros que cruzan la sinapsis (que generalmente no son proteínas), o lo que sucede en respuesta a la señal que cruza la sinapsis, que no siempre es la síntesis de una proteína, o cualquier otra cosa, para el caso ?
Para responder a la segunda parte menos confusa de su pregunta, las proteínas destinadas a ser exportadas desde la célula se sintetizan en el citoplasma o en el retículo endoplasmático (o en ambos), empacadas en vesículas por el aparato de Golgi, y transportadas a través de la célula a través del membrana celular. Nada de esto, sin embargo, ocurre en el núcleo de la célula.
Buena suerte.