Se llama cápside. La mayoría de los virus tienen una cápside que protege su genoma. Por ejemplo, el VHC es un virus muy simple que contiene solo tres proteínas estructurales: la glicoproteína E1 y E2 de la envoltura y la proteína C del núcleo, que forma la cápside.
Fig1: estructura del VHC
Sin embargo, algunos virus tienen una estructura más compleja. Un ejemplo es el VIH. Además de la cápside, hay una capa de proteína llamada matriz, que encierra la cápside y estrecha la envoltura. La matriz determina la morfología del VIH y no está recubierta con envoltura tras fusión con la célula huésped. Dentro de la cápside hay otra capa de proteína estrechamente unida al genoma de ARN viral llamada nucleocápside. Entonces, hay múltiples capas de proteinas en el VIH.
Fig2: estructura del VIH
Algunos virus tienen una matriz y nucleocápside pero no una cápside, como el virus de la rabia. Estos virus aún tienen una capa de proteína, aunque no se llama cápside.
Fig3: estructura del virus de la rabia