¿Cuántos genes se activan en una célula? Me refiero a un número promedio.

La célula es la unidad funcional y estructural básica de cada organismo vivo. Las instrucciones necesarias para dirigir las actividades están contenidas dentro de la secuencia de ADN (ácido desoxirribonucleico). El ADN de todo el organismo consiste en las mismas unidades químicas (bases) llamadas adenina, timina, guanina y citosina que se abrevian A, T, G y C. En cadenas de ADN complementarias, A coincide con T y C con G para formar los pares de bases. El genoma humano (el contenido completo del material genético en una célula) se agrupa en unidades grandes llamadas cromosomas, moléculas separadas físicamente cuya longitud varía entre 50 y 250 millones de pares de bases. Las células humanas contienen dos grupos de cromosomas, uno heredado del padre y otro de la madre. Una célula normal contiene 23 pares de cromosomas, de los cuales 22 son autosomas (1 a 22) y un par son cromosomas sexuales (XX o XY). Sin embargo, generalmente, el espermatozoide y el óvulo contienen la mitad del total del material genético: solo una copia de cada cromosoma.

Cada cromosoma contiene muchos genes, las unidades funcionales y físicas básicas de la herencia genética. Los genes son secuencias específicas de las bases que codifican las instrucciones para formar proteínas. La secuencia de ADN es la disposición longitudinal específica de las bases en la cadena de ADN (por ejemplo, ATTCCGGA). Cada gen tiene una secuencia de ADN específica. Los genes representan solo el 29 por ciento del genoma humano; El resto consiste en regiones no codificadas cuyas funciones pueden ser proporcionar integridad estructural a los cromosomas y determinar dónde, cuándo y cuántas proteínas se producen. Se estima que el genoma humano contiene entre 20,000 y 25,000 genes.

Si bien cada célula contiene un complemento completo de ADN, las células utilizan selectivamente los genes. Por ejemplo, los genes activos en una célula hepática son diferentes de los genes activos en una célula cerebral porque cada célula realiza diferentes funciones y, por lo tanto, necesita proteínas diferentes. Diferentes genes pueden activarse durante el desarrollo o en respuesta a un estímulo externo como una infección o estrés.

Es difícil de decir, pero aquí hay un intento de responder la pregunta. (¡NO es de pared paga!)

Análisis de la expresión específica de tejido humano mediante la integración de genoma completo de transcriptómica y proteómica basada en anticuerpos

Lo primero que notará de la figura son esos números que representan diferentes umbrales (algo llamado FPKM) para ser considerado “expresado / activado”. Dependiendo de su umbral, la respuesta es muy diferente.

Con un punto de corte de 1 FPKM, el número de genes detectados varió de 11.520 en la médula ósea a 15.224 en el testículo.

Este estudio utilizó un número total de genes de 20.050, por lo que es de 57-76%.

No entiendo completamente FPKM, entonces alguien puede agregar comentarios. Pero debería ser lo suficientemente fácil de interpretar en términos relativos. La “activación” es una condición binaria, pero en realidad, los niveles de expresión son relativos en la célula. Usar un umbral de 1 puede ser un poco bajo (una gran cantidad de transcripción no tiene sentido y contar todo lo que observas es engañoso):

Los valores de FPKM (fragmentos por kilobase de modelo de exón por millones de lecturas mapeadas) corrige la longitud de la transcripción y el número total de lecturas mapeadas de la biblioteca para compensar las diferentes profundidades de lectura para diferentes muestras.

La variación entre los tejidos no es tan grande. Esto es porque:

El grupo más grande de genes (46%) son los “genes de mantenimiento” que se expresan en todos los tejidos, lo que respalda los resultados anteriores de que muchos genes se expresan de manera ubicua en las células humanas.

(Personalmente no lo sabía)

No hay un numero promedio Las células son todas diferentes en diferentes puntos de sus vidas. Y todas las celdas funcionan de manera diferente. Y se encienden y apagan constantemente. Entonces las personas son todas diferentes. ¿Cómo va a obtener un número promedio preciso con todas estas variables?

Una célula madre hematopoyética tendrá una expresión diferente dependiendo de los niveles de eritropoyetina. Un linfocito B expresará genes mucho más si hay una infección activa. El cabello es bastante constante, pero ni siquiera podemos contar cuántos pelos tenemos. Y es diferente en todos.

En una célula activa, al menos, miles de genes se activan en un momento dado. Es muy variable.