No es ninguno de los dos: los términos procariota y eucariota se utilizan para describir las células, y las mitocondrias son un orgánulo, no una célula.
Los procariotas son células simples que no tienen organelos unidos a la membrana (es decir, no hay núcleo, mitocondrias, cloroplastos, etc.)
Los eucariotas son células más complejas que sí contienen orgánulos unidos a la membrana.
Sin embargo, se cree que las mitocondrias solían ser procariotas y que fueron engullidas por células más grandes. El procariota luego desarrolla una nueva función dentro de la celda más grande. Esto se llama endysymbiosis: