Leeuwenhoek podría haber descubierto el núcleo dentro de las células de la planta, pero fue hasta el 1800 cuando Bauer y Brown hicieron una clara diferencia entre las células vegetales y animales al observar el núcleo.
El núcleo descrito por Franz Bauer en 1804, y con más detalle en 1831 por el botánico escocés Robert Brown en una charla en la Sociedad Linneana de Londres. Brown estaba estudiando orquídeas bajo el microscopio cuando observó un área opaca, que llamó la “areola” o “núcleo”, en las células de la capa externa de la flor, este descubrimiento cambió el mundo de la botánica.