Supongo que su definición de sistema digestivo es lo suficientemente amplia como para incluir el metabolismo que tiene lugar después de la digestión.
El dispositivo del que estás hablando existe. Se llama pila de combustible, pero nadie ha encontrado la manera de acoplar directamente la oxidación del carbono a la generación de electricidad. La producción del agente reductor, como el hidrógeno, es costosa en energía.
Pila de combustible – Wikipedia