¿Dónde puedo descargar un conjunto de datos de taxones microbianos que están presentes en / en humanos?

El sistema Integrated Microbial Genomes (IMG) es una plataforma de navegación y anotación genómica desarrollada por el Departamento de Energía de EE. UU. (DOE) -Joint Genome Institute.

IMG contiene todos los genomas microbianos preliminares y completos secuenciados por DOE-JGI integrados con otros genomas disponibles públicamente (incluidos Archaea, Bacteria, Eukarya, Virus y Plasmids). IMG proporciona a los usuarios un conjunto de herramientas para el análisis comparativo de genomas microbianos en tres dimensiones: genes, genomas y funciones. Los usuarios pueden seleccionarlos y transferirlos en los carritos de análisis comparativo en función de una variedad de criterios. IMG también incluye una canalización de anotación del genoma que integra información de varias herramientas, incluidas KEGG, Pfam, InterPro y Gene Ontology, entre otras. Los usuarios también pueden escribir o cargar sus propias anotaciones de genes (llamadas anotaciones del gen MyIMG) y el sistema IMG les permitirá generar archivos Genbank o EMBLformat que contengan estas anotaciones.

Sitio web: JGI IMG Integrated Microbial Genomes & Microbiomes