¿Cómo se clasifican las bacterias? ¿Para qué sirve esta clasificación?

1. Además de las descripciones de especies clásicas por morfología y fisiología , también puede ser útil clasificar las bacterias en función de su información genómica . El marcador más común para clasificar e identificar rápidamente las bacterias es el gen 16S rRNA , que codifica para una subunidad ribosómica. Básicamente, el ADN se extrae de un cultivo puro de la bacteria en cuestión, la secuencia del gen 16S se amplifica y se secuencia. Usando una base de datos de referencia, puede clasificar con confianza el organismo hasta el nivel de género. La identificación específica de especies o cepas generalmente requiere un análisis más refinado, por ejemplo, más genes marcadores o técnicas de hibridación directa.
2. El propósito de la clasificación varía según la configuración.

1. Un microbiólogo clínico en un hospital puede querer saber qué tratamiento está indicado para un paciente en particular.
2. Un científico que trabaje con cultivos de enriquecimiento para aislar nuevas bacterias puede querer saber si su estrategia de aislamiento es prometedora o no.
3. Un ecólogo microbiano que investiga la microbiota intestinal de las termitas puede querer saber cómo están estructuradas estas comunidades microbianas intestinales y de qué bacteria están compuestas.
4. Un higienista puede querer verificar si la planta de producción de alimentos que está monitoreando contiene microbios no deseados o posiblemente peligrosos.
5. …

Aquí hay una conversación imaginaria que puede ayudar a explicar los usos clínicos de la clasificación bacteriana:

“Parece que el paciente tiene algún tipo de infección bacteriana”.

“Pero, ¿qué tipo de bacteria causó? ¿Tal vez podríamos usar un tipo específico de antibiótico para detener la infección?

“Ni idea. Probemos un antibiótico al azar y veamos si funciona. Si no lo hace, continuaremos por prueba y error hasta que algo funcione “.